序章　進化学の「源流」をたどる旅への出発
第１章　ダーウィンを取り巻く英国博物学の空気
第２章　ヘッケルとドイツ体系学の系譜
第３章　描かれる進化の図像―分類、系統、マップ、ネットワーク
第４章　生物多様性を体系化する―時間軸と空間軸の可視化の試み
第５章　体系思考と進化思考―存在と過程を探究する方法論
第６章　二一世紀の進化学と体系学―温故知新か偶像破壊か
終章　系統樹なくしては何ものも意味をもたない